Strukturní studie represorů bakteriální transkripce
Bakteriální represory hrají klíčovou roli v transkripční regulaci genů. Mezi hlavní skupiny regulátorů metabolických genů patří rodiny GntR a SorC/DeoR. Navzdory svému významu zůstávají molekulární mechanismy, které jsou základem příslušných regulačních funkcí, z velké části neprozkoumané. Pochopení trojrozměrné struktury těchto proteinů je pro odhalení zmíněných procesů zásadní a může mít význam i pro ostatní členy proteinových rodin. Soustředíme se na členy rodiny SorC/DeoR u B. subtilis: bsDeoR a bsCggR, reprezentující odlišné podrodiny. Prostřednictvím stanovení krystalové struktury odhalujeme mechanismus rozpoznávání DNA u těchto regulátorů zkoumáním jejich N-koncových DNA-vazebných domén v komplexu s minimálními operátorovými sekvencemi. Kromě toho strukturně charakterizujeme plnodélkové proteiny vázané na kompletní DNA operátory. Naše výsledky odhalují sdílenou globální architekturu a společný mechanismus vazby na DNA pro oba represory. Prezentujeme základní mechanismus funkce transkripčních regulátorů rodiny SorC a tvoříme tak rámec pro budoucí základní i aplikovaný výzkum v této oblasti.
Kontakt: Adéla Fejfarová, Jana Škerlová, Pavlína Maloy Řezáčová
